Biblioteca UDG conține peste 20 000 de volume în limba română şi rusă, precum şi în limbi de circulaţie internaţională şi limbi clasice, fiind printre cele mai avansate biblioteci creștine din Moldova. Biblioteca universităţii dispune de sală de lectură, cartotecă electronică, acces direct la diferite materiale (cărți, presa periodică, literatură de referință, materiale didactice, hărți, materiale electronice ș. a.), oferind şi o deservire rapidă și calitativă. Acest departament se află în permanentă dezvoltare și creștere de fonduri în mai multe domenii, cum ar fi: teologie, misiologie, filosofie, religie, asistenţă socială, consiliere, pedagogie, psihologie, literatură universală, management etc.